תרומתה של "אגד" לאיכות הסביבה חשובה מאין כמותה: פועלת להפחתת הנסיעה ברכבים פרטיים, להקל על עומסי תחבורה ולהפחית בשימוש באנרגיה ובפליטות פחמן. "אגד", כמובילה בתחום התחבורה הציבורית בישראל, שואפת לשפר ולהרחיב את תרומתה לאיכות הסביבה ולכן היא משקיעה משאבים ניכרים בתחום, המוערכים בכ- 5.5 מיליון שקלים מידי שנה.  בין התחומים בהם אגד פעילה, במטרה לתרום לאיכות הסביבה, ניתן למנות:
 

הרחבת צי האוטובוסים החשמליים

בשנים האחרונות ייבאה אגד אוטובוסים חשמליים, שהוטמעו בצי שלה ופעילים כבר היום באזור חיפה והקריות ובירושלים. אגד נערכת לקליטת עשרות אוטובוסים חשמליים נוספים במטרה לצמצם את השימוש בדלק וסולר. האוטובוסים החשמליים הוכיחו את עצמם כאמצעי הטוב ביותר לשימוש באנרגיה ירוקה ולהקטנת פליטות הפחמן והפיח.
 

התקנת מערכי חסכון באנרגיה

חלק מהאוטובוסים של אגד מצויידים במערכות TRAFFILOG התורמת לחסכון של עד 2.5% בתצרוכת הדלק של האוטובוסים ומונעת בלאי ושחיקה של כלי הרכב.
 

בחינת חלופות אנרגטיות

הקבוצה מאתרת ובוחנת חלופות לשימוש באנרגיות חלופיות, דוגמת שילוב אוטובוסים היברידיים, שימוש בביו אנרגיה ועוד.
הפחתת זיהום אויר אגד עומדת בהצלחה ביעדים להפחתת זיהום אוויר שנקבעו בהוראות המשרד להגנת הסביבה, בתקנות וחוקי העזר השונים, וכן פועלת לקיום כל יתר התנאים שנקבעו בחוק. אגד מחויבת להמשיך ולצייד את ציי הרכב שלה בכלים בעלי מערכות הנעה חלופיות התורמים להפחתת הזיהום. נהגי אגד עוברים הדרכות מקצועיות המכשירות אותם בנהיגה חסכונית וחכמה התורמת לשיפור איכות האוויר.

 

שימוש בחומרים מסוכנים ודלקים

"אגד" ממלאת באדיקות את הוראות האחסון, השימוש והפסולת בחומרים מסוכנים. האגודה מחזיקה בהיתרי רעלים שונים הנדרשים לפעילותה בהתאם לחוק החומרים המסוכנים, ופועלת לעמידה בתנאיהם ולחידושם בתום תוקפם. כמתחייב מתקנות המים, אגד מנהלת מערך בדיקות קפדניות לאטימות למכלי דלק תת קרקעיים ולצנרת הובלה בכל תחנות התדלוק הפנימיות שלה ומקיימת שיתוף פעולה עם המשרד להגנת הסביבה בנושא.
 

בקרת קרינה

לצורך הפעלת צי של אוטובוסים בעלי הנעה חשמלית, אגד הקימה ומפעילה עמדות טעינה של אוטובוסים בחניון בקרית חיים. הקבוצה מחזיקה בהיתר הפעלה של מקור קרינה מהמשרד להגנת הסביבה ופועלת לעמידה בתנאיו.
 

טיפול ואחזור שפכים

אגד מקפידה על טיפול וניקוז שפכים תעשייתיים כדי למנוע זיהום של הסביבה ומקורות מים תת קרקעיים. במתקנים בהם מתבצעת שטיפה של אוטובוסים מותקנת מערכת למחזור מי השטיפה כדי לחסוך במים וכדי למנוע חלחול מים לביוב.
 

זיהום קרקע ומי תהום

לפני כעשור החלה אגד לבצע פעולות לסקירה של זיהומי קרקע ומי תהום במתקניה בהתאם לדרישות המשרד להגנת הסביבה וכחלק מהיערכותה לפינוי מתקנים מסוימים. סקרי קרקע ובקרת איכות מבוצעים כדרך קבע ותורמים הן לשיפור שיפור הקרקע והן ברמת התפעול השוטף.
 

טיפול ומחזור פסולת

אגד מנהלת ומפעילה מערך משמעותי שמטרתו למחזר פסולת ולמנוע זיהום סביבתי, לרבות: מחזור שמן, מחזור צמיגים, גריטה ומחזור מתכת ופלדה, וטיפול בפסולת נייר ופסולת אלקטרונית.